三国志战略版诸葛亮最怕指挥/被动/突击战法阵容、当锋摧决伪报、兵种克制、高智力减伤武将与强控打断，这五类克制能精准瓦解其控场与输出核心。
诸葛亮核心依仗是自带指挥战法神机妙算，可锁定敌军主动战法并打断，主将位还能凭智力差增伤，但该机制对指挥、被动、突击战法完全无效。像司马懿盾、爆头骑、三势吕这类阵容，核心输出与防御均不靠主动战法，诸葛亮无法触发打断，谋略伤害也难打满，控场价值直接减半。尤其突击流的夏侯渊、孙权，高频普攻搭配突击战法，能无视神机妙算的限制快速压低诸葛亮队伍血线。
当锋摧决是克制诸葛亮的关键战法，其伪报效果可直接封禁神机妙算的指挥机制，让诸葛亮彻底失去打断能力。搭配该战法的武将如太史慈、SP马超，可精准针对诸葛亮主将位，破掉其核心防御与控场体系，后续队伍可轻松跟进输出。赵云自带的一身是胆能免疫控制，抵消诸葛亮的智力差增伤，全程稳定输出，是克制诸葛亮的优质武将选择。
兵种克制是压制诸葛亮的基础手段，其常用弓兵、枪兵阵容存在明显短板。弓兵诸葛亮怕骑兵冲脸，三势吕、渊骑等高爆发骑兵可利用兵种克制快速突破防线，压低血线；枪兵诸葛亮则被盾兵克制，司马懿盾、魏盾等盾兵阵容，搭配藤甲兵可大幅减免谋略伤害，稳稳抗住输出并反打。实战中可根据诸葛亮的兵种选择，灵活切换克制兵种，降低其作战效率。
诸葛亮智力虽顶尖，但面对高智力减伤武将与强控阵容时优势尽失。司马懿、周瑜等高智力武将，能减少神机妙算的谋略伤害，搭配八门金锁阵、草船借箭等减伤驱散战法，可进一步削弱其输出。同时，诸葛亮抗性较弱，程昱的叛逃、贾诩的混乱等负面效果，能绕过其防御造成稳定伤害，箕形阵还可降低其主将加成，多重限制下难以发挥作用。
